現任主任：吳至行(2019.8~)
歷任主任：張智仁(1988.6~2001.7)、盧豐華(2001.8~2004.7)、吳晉祥(2004.8~2007.7, 2013.8~2019.7)、楊宜青(2007.8~2013.7)

沿革：

　　家庭醫學的目的在培育優秀的家庭醫師，提供質與量俱佳的全人醫療服務。我國於1982年行政院科技顧問會議決議在各醫學院成立家庭醫學科後，家庭醫學科就陸續於各醫學院中開設。1984年成大醫學院成立時，即設有家庭醫學科；1988年成大附設醫院成立時，同時就成立家庭醫學部，在服務方面開設有家庭醫學一般門診、健康體檢門診、住院健檢病房並支援偏遠地區衛生所暨群醫中心等。在教學方面，提供住院醫師的養成教育訓練、醫學系及相關科系學生之見實習課程教學、舉辦基層醫師繼續教育，參與臺南地區醫療網相關服務與教學活動。在研究方面則以臺灣地區國人常見疾病及社區流行病學為重點。本部一向秉持著競競業業的精神，希望在服務、教學及研究上能不斷進步與成長。

住院醫師訓練內容：

　　家庭醫學部住院醫師的訓練，完全依照學會所規定的內容進行，共有至少三年的訓練，第一年的訓練課程包括內科、急診醫學科、小兒科及家庭醫學科各兩個月，婦產科、精神科、放射診斷科及社區醫學各一個月。第二年的訓練課程包括內科二個月，外科、小兒科、婦產科、皮膚科、耳鼻喉科、復健科、精神科、社區醫學、眼科及神經科各一個月。第三年的訓練課程包括家庭醫學科門診行政二至三個月、安寧緩和醫療及老年醫學訓練各一個月、社區醫學三至四個月、及選修部定西醫專科共四個月；另有全年度的研究訓練及居家照顧訓練，每週一至二個半天。第四年於修滿學會相關課程後可依個人興趣選擇各類次專科的認證。此外，各級住院醫師皆需接受門診診察病人的看診訓練，在第一年為每週一次、第二年為每週兩次、第三年為每週三次，第四年為每週四次。經由完整教學服務研究訓練完成後，每位住院醫師不僅能獨當一面服務門診病人，也具有研究的技能與教學的熱忱。同時住院醫師均可順利考上家庭醫學專科醫師執照，截至目前為止本部訓練完成住院醫師考照率為百分之一百。而訓練完成後的出路也非常寬廣，無論留在醫院體系、繼續唸碩博士班進修、衛生所擔任主任、或基層開業等，每位表現都是令人刮目相看。

學術研究：

1. 台南市居民的慢性病長期追蹤調查研究。
2. 台南市老年人慢性病長期追蹤調查研究。
3. 台南市老年人用藥情況之流行病學調查研究。
4. 肥胖與減重之相關研究。
5. 糖尿病衛生教育之相關研究。
6. 居家護理及另類療法之相關研究。

家庭醫學部LOGO：

• 文字部分：NCKUHFM成大醫院家庭醫學部成立於1988年
• 由FM字型組成之城堡造型：代表台南府城，也像徵以社區為範疇，也代表家醫科FM是維護全家健康的穩固基石。
• 四個人偶：代表照顧對象不分男女老少，也像徵家庭組成，照顧全家。
• 人形屋頂：代表以人為本，家庭醫師強調全人照顧，是家庭的守護者。
• 中間蛇杖：象徵醫學專業，驅逐病魔，追求健康，也代表醫德中立
• 最上圖四色輪轉圓環：象徵兼顧「生物、心理、社會、環境」(Biological , psychological, social and environmental approach)，也代表家庭醫學部的四個次分科「家庭醫業、行為科學、預防保健、社區醫學」，不斷輪轉綜合運用。